Come tutti i cani Giapponesi lo Shikoku ha un doppio mantello costituito da grossi peli ispidi esterni e da un sottopelo che ricambia stagionalmente. Tutti gli Shikoku devono avere il cosiddetto “urajiro” che è la loro tipica coda a ricciolo portata sul dorso, altra caratteristica sono marcature di colore bianco o crema in porzioni ventrali del corpo, sulle gambe, sulle guance e in fronte ed a differenza degli Akita e Shiba non hanno una netta forma del bianco sul petto. Altra particolarità è che secondo lo standard NIPPO e JKC esiste un’altra colorazione, oltre quelle indicate da FCI, e cioè il Black & Tan, la quale non è da considerarsi un difetto ed anzi questi Shikoku vengono usati nella riproduzione per ottenere un pelo migliore nella prole.